More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3807 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3807  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) beta chain  100 
 
 		 350 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4445  Transketolase central region  91.43 
 
 		 350 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0810  putative pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  58.45 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0706  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  58.45 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3449  Transketolase domain protein  47.65 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.54 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  44.98 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  40.25 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  45.22 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  44.85 
 
 		 339 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  39.25 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  43.2 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  38.39 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  41.88 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  43.84 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  41.43 
 
 		 328 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  42.86 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  42.86 
 
 		 340 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.34 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  42.86 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  39.63 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  44.88 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  39.63 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  46.86 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  45.58 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  46.08 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.67 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  41.67 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.67 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.67 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  40.62 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.67 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  41.67 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.67 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  41.37 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  43.12 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  41.85 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.48 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  41.8 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.07 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  44.8 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  41.69 
 
 		 339 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  41.72 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  44.75 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.83 
 
 		 469 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  41.37 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.14 
 
 		 459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  44.37 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.85 
 
 		 467 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  40 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  44.14 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  40.3 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.03 
 
 		 465 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  42.81 
 
 		 344 aa  235  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  41.98 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  40.81 
 
 		 325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  41.77 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  37.85 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  44.59 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.18 
 
 		 465 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  37.81 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.88 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  39.08 
 
 		 327 aa  232  9e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.14 
 
 		 456 aa  232  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  41.28 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5078  Transketolase central region  45 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  41.01 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  42.46 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  45.26 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.83 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.47 
 
 		 480 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  36.76 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  38.2 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.44 
 
 		 465 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  41.72 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.38 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.64 
 
 		 482 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  38.87 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  41.1 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  41.1 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  41.1 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.13 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5071  Transketolase central region  41.49 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.067721  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.31 
 
 		 469 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.03 
 
 		 483 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.47 
 
 		 497 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.25 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  42.49 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.25 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  41.95 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.47 
 
 		 480 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.14 
 
 		 449 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  43.1 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  40.67 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  41.96 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  39.87 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  43.19 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  39.2 
 
 		 451 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  39.81 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  43.03 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>