110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0737 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0737  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.390788  normal  0.0887326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2090  extracellular solute-binding protein family 3  48.11 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2484  extracellular solute-binding protein family 3  46.33 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1776  extracellular solute-binding protein  45.17 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1788  periplasmic binding protein, putative  41.2 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000915129 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6250  extracellular solute-binding protein family 3  41.63 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0481  periplasmic binding protein, putative  38.08 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0692  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0808648  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1338  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.718628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2815  extracellular solute-binding protein family 3  39 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1539  extracellular solute-binding protein family 3  34.04 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1002  hypothetical protein  37.21 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4872  extracellular solute-binding protein family 3  35.04 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2410  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3623  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175037  normal  0.0350422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1959  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369484  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  31.14 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1889  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1856  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2256  hypothetical protein  28.77 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2731  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.476445  normal  0.605201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2662  hypothetical protein  25.97 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.711055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  24.28 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.43 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  45.28 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.07 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 271 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  23.64 
 
 		 268 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  23.81 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  29.45 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.45 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.45 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  23.31 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2702  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  25.44 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  21.38 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.94 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  25.61 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  50.94 
 
 		 261 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  35 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.92 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  26.04 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3711  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  46.67 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6372  extracellular solute-binding protein family 3  25.09 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.91 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  21.83 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1130  hypothetical protein  23 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  25.93 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  24.25 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.17 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  24.37 
 
 		 485 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  26.09 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.72 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.59 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  32.12 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  47.46 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12400  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  43.64 
 
 		 346 aa  43.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1126  hypothetical protein  24.03 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.18 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  30.68 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  24.26 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>