235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1776 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1776  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 295 aa  587  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2484  extracellular solute-binding protein family 3  69.5 
 
 		 293 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2090  extracellular solute-binding protein family 3  68.32 
 
 		 293 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0737  extracellular solute-binding protein  45.17 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.390788  normal  0.0887326 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6250  extracellular solute-binding protein family 3  46.26 
 
 		 285 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1788  periplasmic binding protein, putative  45.1 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000915129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1002  hypothetical protein  40.21 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2815  extracellular solute-binding protein family 3  43.02 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0481  periplasmic binding protein, putative  40.23 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0692  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0808648  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1959  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369484  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1889  hypothetical protein  30.65 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  32.98 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1338  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.718628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2256  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1539  extracellular solute-binding protein family 3  33.8 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1856  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2731  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.476445  normal  0.605201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4872  extracellular solute-binding protein family 3  33.09 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2410  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3623  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175037  normal  0.0350422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2662  hypothetical protein  29.12 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.711055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  28.52 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.72 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  24.73 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.17 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.51 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  24.02 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.5 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  24.71 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.49 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  26.02 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.02 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  25.69 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  24.91 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.17 
 
 		 248 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.4 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.4 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.39 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  25.69 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.85 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.17 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5989  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  23.13 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05529  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  24.7 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2578  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_003296  RS00359  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.72 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3278  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  21.15 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.21 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  22.69 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.44 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>