38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2815 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2815  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1002  hypothetical protein  50.18 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6250  extracellular solute-binding protein family 3  41.38 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0692  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0808648  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1788  periplasmic binding protein, putative  39.36 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000915129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2090  extracellular solute-binding protein family 3  40.35 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2484  extracellular solute-binding protein family 3  40.77 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1776  extracellular solute-binding protein  43.07 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0737  extracellular solute-binding protein  39 
 
 		 301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.390788  normal  0.0887326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2256  hypothetical protein  30.58 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  36.02 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1889  hypothetical protein  29.45 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1856  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1959  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369484  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2662  hypothetical protein  31.78 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.711055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2731  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.476445  normal  0.605201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1539  extracellular solute-binding protein family 3  34.59 
 
 		 289 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0481  periplasmic binding protein, putative  34.36 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1338  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.718628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4872  extracellular solute-binding protein family 3  32.82 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3623  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175037  normal  0.0350422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2410  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.57 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  32.5 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.89 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  23.05 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.63 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  24.6 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 264 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>