106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3623 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3623  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175037  normal  0.0350422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4872  extracellular solute-binding protein family 3  64.39 
 
 		 290 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1338  extracellular solute-binding protein  63.25 
 
 		 289 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.718628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1539  extracellular solute-binding protein family 3  62.9 
 
 		 289 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2410  extracellular solute-binding protein  64.2 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0692  extracellular solute-binding protein  42.13 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0808648  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2256  hypothetical protein  32.3 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1856  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  35.64 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1959  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369484  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1889  hypothetical protein  27.84 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2662  hypothetical protein  34.11 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.711055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0737  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.390788  normal  0.0887326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2090  extracellular solute-binding protein family 3  35.21 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2484  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1002  hypothetical protein  33.91 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6250  extracellular solute-binding protein family 3  35.8 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2815  extracellular solute-binding protein family 3  35.43 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1788  periplasmic binding protein, putative  35.07 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000915129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0481  periplasmic binding protein, putative  35.29 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1776  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2731  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 338 aa  99  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.476445  normal  0.605201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.98 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.43 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.02 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  44.78 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  25.53 
 
 		 299 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.85 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  25 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  22.46 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.9 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  26.15 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4525  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.42 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  28.14 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  26.17 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.05 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.56 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  29.68 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  26.83 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  34.88 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  27.03 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3315  extracellular solute-binding protein family 3  22.18 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  31.01 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  31.01 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  30.71 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  31.01 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  31.01 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  38.82 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  31.01 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  31.01 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  31.01 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  24.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  34.88 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  24.73 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  24.73 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  24.73 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  26.94 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  32.69 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  23.16 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  24.73 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  32.28 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.82 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>