71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3735 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 277 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4872  extracellular solute-binding protein family 3  26.1 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1338  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.718628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1539  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.8 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  27.83 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2256  hypothetical protein  22.38 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1856  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 1322 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 2654 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  24.82 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  25.35 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  24 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2662  hypothetical protein  24.23 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.711055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  22.43 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.73 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  29.63 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  20.52 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1889  hypothetical protein  20.92 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3705  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  22.65 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  22.76 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1002  hypothetical protein  25.09 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  21.55 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  23.63 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  23.2 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  27.59 
 
 		 922 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  23.65 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  24.12 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  20.26 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.18 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 		 1279 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  24.33 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.11 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.85 
 
 		 1251 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.11 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  22.73 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1122  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  27.89 
 
 		 565 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  21.93 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0246  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.469708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  22.75 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0821  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206084  normal  0.0792038 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0849  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0366  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.996881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0240  extracellular solute-binding protein family 3  23.18 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>