68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5951 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  58.6 
 
 		 282 aa  341  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  51.06 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  47.25 
 
 		 282 aa  258  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  49.58 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  46.04 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  47.2 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  47.47 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  46.06 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  46.96 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  41.64 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  41.64 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  43.15 
 
 		 284 aa  214  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  39.52 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 278 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  38.52 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  39.8 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  41.53 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.31 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  37.55 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  39.08 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  38.21 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  30.45 
 
 		 581 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  29.69 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  26.92 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  27.94 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  24.47 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  25 
 
 		 190 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  24.82 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  22.13 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.89 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.24 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  26.13 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2858  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  24.17 
 
 		 856 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1739  extracellular solute-binding protein family 3  29.29 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 253 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  30.54 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  30.54 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.54 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  28.07 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>