63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2580 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  100 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  99.27 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  85.98 
 
 		 270 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  64.98 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  65.48 
 
 		 282 aa  344  7e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  62.69 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  49.58 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  50.41 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  51.22 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  42.03 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  44.72 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  44.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  41.51 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  41.51 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  41.04 
 
 		 284 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  38.69 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  38.84 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  39 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  36.14 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  36.58 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.21 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  39.58 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  34.03 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  28.09 
 
 		 581 aa  92  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  28.8 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  27.39 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  26.56 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  26.95 
 
 		 990 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  26.95 
 
 		 990 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.64 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  27.27 
 
 		 190 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  22.47 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.18 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.82 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.73 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6202  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.288537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.76 
 
 		 343 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.97 
 
 		 748 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>