54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2345 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  78.15 
 
 		 278 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  82.14 
 
 		 287 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  60.31 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  55.65 
 
 		 272 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  49.59 
 
 		 282 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  42.56 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  38.52 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  40.16 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  40.57 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  37.85 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  39.67 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  38.84 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 		 307 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  37.07 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  37.54 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  33.7 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  38.68 
 
 		 581 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 289 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.07 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  35.91 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  34.32 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  34.9 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  29.31 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2305  extracellular solute-binding protein family 3  26.75 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000714042  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  23.27 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  26.09 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1201 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  31.09 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>