78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1590 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  24.47 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  25.55 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  26.62 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  24.75 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  27.69 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  25.24 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  23.14 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1970  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  25.58 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  25.64 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  25.58 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  24.24 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  22.87 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  28.35 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  28.04 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.19 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  22.16 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.66 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  21.71 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 298 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.09 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.72 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  20.99 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  22.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.75 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0215  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  22.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  22.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  22.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  22.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.96 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0592  extracellular solute-binding protein family 3  27.12 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  21.96 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.66 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  21.96 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  21.96 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  21.96 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.48 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0308  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.52 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  23.96 
 
 		 417 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3770  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_004310  BR0295  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.52 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1889  hypothetical protein  23.78 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  21.57 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1959  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369484  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0700  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  22.9 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.347684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  24.33 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0186  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 291 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>