More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2305 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2305  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000714042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2235  extracellular solute-binding protein  63.7 
 
 		 279 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0981376  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 		 510 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2296  extracellular solute-binding protein family 3  57.14 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1532  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.63 
 
 		 521 aa  258  9e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000742364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0214  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  48.74 
 
 		 516 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.002492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0751  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  51.24 
 
 		 545 aa  253  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0389728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0086  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  47.43 
 
 		 537 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0796672  normal  0.210719 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0136  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  46.25 
 
 		 516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000337877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  31.8 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 		 485 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 		 485 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  32.91 
 
 		 485 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  32.1 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  32.1 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  31.01 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.73 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  30.92 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.12 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  29.55 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  32.72 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.52 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.51 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.51 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.52 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  30.6 
 
 		 490 aa  99.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 246 aa  99  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.96 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.34 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 250 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.64 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.49 
 
 		 503 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.64 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  28.21 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.12 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  30.09 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.68 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.46 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  27.6 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  28.51 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  27.84 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  31.22 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.73 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 264 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.76 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.7 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.29 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.78 
 
 		 258 aa  85.5  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.12 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.28 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  26.91 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  31.28 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>