More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3148 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  100 
 
 		 581 aa  1188    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  40.25 
 
 		 272 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 305 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 		 277 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  39.6 
 
 		 282 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 278 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 287 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 		 293 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 		 286 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 273 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  35.68 
 
 		 284 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  34.87 
 
 		 288 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  35.97 
 
 		 296 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 284 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  34.23 
 
 		 284 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  32.92 
 
 		 282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 		 298 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  35.86 
 
 		 291 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 		 307 aa  127  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 289 aa  124  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  30.45 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.49 
 
 		 303 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  29.12 
 
 		 284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 304 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  36.45 
 
 		 1156 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 296 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 		 300 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 291 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 280 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 285 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 302 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 		 282 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 		 292 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 270 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1585 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  29.77 
 
 		 285 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1402 aa  98.2  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 274 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  28.09 
 
 		 274 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 309 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  32.06 
 
 		 278 aa  92.8  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 276 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  28.1 
 
 		 715 aa  92.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  34.56 
 
 		 870 aa  92.8  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 		 281 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  31.22 
 
 		 954 aa  91.3  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  27.95 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  30 
 
 		 479 aa  91.3  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 1030 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  28.44 
 
 		 404 aa  87.8  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  28.04 
 
 		 253 aa  87.4  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.51 
 
 		 2413 aa  87  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  31.56 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  30.84 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  29.15 
 
 		 855 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  31.72 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30.38 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  26.27 
 
 		 723 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  28.02 
 
 		 762 aa  84  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  28.57 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.13 
 
 		 490 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  28.78 
 
 		 865 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  30.77 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  27.16 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  32.11 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  31.78 
 
 		 756 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  31.35 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  32.57 
 
 		 931 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  27.48 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  26.15 
 
 		 750 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  33 
 
 		 217 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1249 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  30.37 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  25.69 
 
 		 1061 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 		 1198 aa  77.8  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1005 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  26.98 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  30.66 
 
 		 4520 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  32.78 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  29.91 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  33.7 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  28.15 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  25.1 
 
 		 2171 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05168  NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07030)  27.91 
 
 		 1307 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6235  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02195  conserved hypothetical protein  31.79 
 
 		 1800 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  26.92 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  29.89 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.76 
 
 		 731 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1640  hypothetical protein  30.34 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.951385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  25.46 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  27.46 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  29.74 
 
 		 821 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  32.42 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  22.43 
 
 		 711 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  35.44 
 
 		 191 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0099  Ankyrin  27.41 
 
 		 230 aa  69.3  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5207100000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 		 1133 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  31.38 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>