68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5754 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 298 aa  594  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  91.47 
 
 		 288 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  74.63 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  67.03 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  67.03 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  70.66 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  55.95 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  47.47 
 
 		 291 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  46.56 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  43.9 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  43.77 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  42.02 
 
 		 282 aa  212  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  44.26 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  44.44 
 
 		 274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  39.83 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  40.16 
 
 		 277 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  37.72 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  40.48 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  37.5 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.81 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  38.1 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  33.61 
 
 		 581 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  28.93 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  29.69 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  31.73 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  28.41 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  27.24 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  28.92 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.23 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  27.51 
 
 		 262 aa  45.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.04 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.61 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.73 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4136  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.502518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  25.97 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.39 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>