52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0472 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  63.31 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  60.41 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  59.77 
 
 		 296 aa  328  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  59.77 
 
 		 300 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  61.63 
 
 		 292 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  52.19 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  40.41 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  43.43 
 
 		 190 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  34.32 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  29.32 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 289 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  30.49 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  29.32 
 
 		 581 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  30.98 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  26.92 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  28.62 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  28.8 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  25.09 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  26.72 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  25.95 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.79 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.08 
 
 		 510 aa  48.9  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.3 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.3 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25.3 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25.3 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.9 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.9 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  24.51 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>