42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2425 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 303 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  68.21 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  62 
 
 		 291 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  48.16 
 
 		 291 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  47.29 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  44.48 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  44.4 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  36.33 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  35.31 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  35.07 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  36.86 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  35.22 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  35.86 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  35.86 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  34.96 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  35.23 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  35.06 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  29.84 
 
 		 581 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  26.25 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  23.79 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  23.37 
 
 		 190 aa  53.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  24.32 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>