43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3386 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  52.35 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  53.76 
 
 		 277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  52.57 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  52.78 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  49.19 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  41.08 
 
 		 288 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  38.59 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  40.76 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  37.34 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  39.08 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  41.09 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  37.24 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  40.25 
 
 		 581 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  36.08 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.06 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  34.57 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  34.52 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  35.18 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  31.77 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  34.45 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  34.03 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  28.89 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  32.41 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  27.08 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  27.41 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>