44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0300 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  52.61 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  48.16 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  50.38 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  44.4 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  43.2 
 
 		 291 aa  234  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  37.55 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  39.68 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  35.67 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  38.85 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  38.2 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  36.58 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  34.28 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  36.08 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  33.7 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  37.08 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  33.08 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  29.3 
 
 		 581 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  28.62 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  28.68 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  26.07 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  26.82 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  28.19 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  25.13 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5966  ABC transporter periplasmic-binding protein  37.5 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.981585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>