43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4517 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  97.67 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  87.67 
 
 		 292 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  79.67 
 
 		 302 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  65.86 
 
 		 281 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  59.77 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  48.63 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  45.24 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 		 280 aa  228  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  42.28 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  46.89 
 
 		 190 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  34.39 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  36.6 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  35.91 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  32.19 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  30.85 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  28.86 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  32.68 
 
 		 581 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  31.05 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  32.14 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 270 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  27.91 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  29.28 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  26.07 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.49 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>