71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2147 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  92.25 
 
 		 284 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  68.61 
 
 		 286 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  70.98 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  69.02 
 
 		 298 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  51.38 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  41.64 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  43.72 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  41.09 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  41.06 
 
 		 270 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  41.15 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  40.74 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  40.08 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  37.34 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 		 273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  38.13 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  36.21 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.22 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  35.67 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  34.17 
 
 		 581 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  34.92 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  32.52 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  31.71 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  30.49 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 276 aa  99.4  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  28.18 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  26.84 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  24.6 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  28.79 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  28.57 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  28.57 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.44 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  29.63 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.7 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.84 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.94 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  31.86 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  25.45 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>