62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5979 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  91.47 
 
 		 298 aa  487  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  73.9 
 
 		 286 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  68.71 
 
 		 284 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  68.71 
 
 		 284 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  73.64 
 
 		 284 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  56.75 
 
 		 307 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  45.36 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  43.82 
 
 		 282 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 		 270 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  44.67 
 
 		 282 aa  218  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  43.07 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  44.67 
 
 		 274 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  44.86 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  41.08 
 
 		 272 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  38.95 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  41.15 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  41.27 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  38.43 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  38.52 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  39.02 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  34.29 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  34.45 
 
 		 581 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  31.05 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  30.61 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  30.22 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 276 aa  95.5  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  29.21 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1210  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  27.81 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3874  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.92 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.09 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.97 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4136  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.88 
 
 		 260 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.502518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  28.24 
 
 		 727 aa  42.7  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>