51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4631 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 292 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  90.54 
 
 		 296 aa  547  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  89 
 
 		 300 aa  527  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  80.49 
 
 		 302 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  67.07 
 
 		 281 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  58.42 
 
 		 285 aa  329  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  52.36 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  41.64 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  45.63 
 
 		 276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  47.46 
 
 		 190 aa  175  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  35.18 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  36.33 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  34.75 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  32.82 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  31.82 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  29.25 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  31.5 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  30.61 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  31.35 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 270 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  26.67 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  27.4 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  28.03 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.49 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  26.52 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.58 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.58 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.58 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.58 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>