44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1828 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 283 aa  566  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  43.09 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  38.49 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  41.06 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  41.56 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  47.85 
 
 		 190 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  30.28 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  30.04 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  30.23 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  31.27 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  26.88 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  28.34 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  28.1 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.32 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  27.05 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  28.32 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  25.71 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 584 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  21.74 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>