41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5966 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5966  ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1959  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369484  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  24.14 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  26.77 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  25.67 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  25.67 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  25.67 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.09 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.09 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  23.83 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0037  hypothetical protein  27.87 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1002  hypothetical protein  24.29 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  24.9 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1471  hypothetical protein  25.74 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  24.71 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.37 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  20.3 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1512  hypothetical protein  25.32 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  24 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.38 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  21.97 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  21.69 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  24.81 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.91 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  22.74 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  37.5 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>