77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3542 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  100 
 
 		 610 aa  1241    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  31.35 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  26.89 
 
 		 497 aa  181  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  26.75 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  27.18 
 
 		 507 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  25.62 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  26.74 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.7 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  23.49 
 
 		 597 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  25.21 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25.81 
 
 		 541 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  24.2 
 
 		 592 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  22.22 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  23.7 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  21.63 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  25.11 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  22.04 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 583 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  25.23 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 636 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 644 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  24.9 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  21.81 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  21.55 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.87 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  27.96 
 
 		 497 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  23.64 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  24.55 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.8 
 
 		 864 aa  63.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  24.43 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  23.66 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  24.15 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  27.93 
 
 		 641 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  22.27 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  29.17 
 
 		 496 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.02 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25.11 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  25.74 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  26.34 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 		 496 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  21.6 
 
 		 493 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  24.42 
 
 		 506 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 505 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  25.59 
 
 		 557 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  25.17 
 
 		 490 aa  55.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  21.77 
 
 		 508 aa  54.7  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  26.05 
 
 		 544 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  24.68 
 
 		 497 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  25 
 
 		 522 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  25.43 
 
 		 539 aa  54.3  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  25.99 
 
 		 481 aa  53.9  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  26.92 
 
 		 527 aa  53.9  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.57 
 
 		 505 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  29.14 
 
 		 498 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  21.7 
 
 		 487 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  21.46 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  23.86 
 
 		 503 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 526 aa  52  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  25.25 
 
 		 502 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  24.66 
 
 		 489 aa  50.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  25.2 
 
 		 812 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.58 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.53 
 
 		 531 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  34.62 
 
 		 493 aa  48.5  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  26.44 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  21.28 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  27.07 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 601 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 497 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  24.05 
 
 		 473 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  20.5 
 
 		 512 aa  44.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  24.62 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>