50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3323 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1184    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  51.62 
 
 		 644 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  51.32 
 
 		 592 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  51.8 
 
 		 641 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  33.62 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  29.3 
 
 		 497 aa  156  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  29.17 
 
 		 497 aa  156  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.04 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  28.21 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.11 
 
 		 610 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 502 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  26.51 
 
 		 502 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  29 
 
 		 513 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  29.07 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  27.16 
 
 		 528 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  27.32 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  26.04 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  24.02 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.21 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  24.77 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  27.55 
 
 		 583 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  29.9 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  29.9 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  28.21 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25.64 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  22.55 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  22.73 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  22.47 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  23.74 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  26.18 
 
 		 465 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  27.53 
 
 		 544 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  25.89 
 
 		 539 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  33.03 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  26.21 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 498 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  27.01 
 
 		 475 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  32.65 
 
 		 494 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.49 
 
 		 557 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  26.44 
 
 		 499 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.75 
 
 		 864 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  26.04 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  37.5 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  22.16 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 		 636 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  24.46 
 
 		 812 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 505 aa  43.9  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  24.68 
 
 		 550 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  24.68 
 
 		 550 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>