32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0558 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1082    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  49.53 
 
 		 583 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  30.75 
 
 		 513 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  34.14 
 
 		 516 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  31.57 
 
 		 513 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  30.77 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  28.06 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  26.64 
 
 		 534 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  26.41 
 
 		 535 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  31.16 
 
 		 539 aa  100  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  25.49 
 
 		 497 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  25.49 
 
 		 497 aa  87.4  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.53 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  29.95 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.05 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  27.53 
 
 		 597 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  23.15 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  27.56 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  24.62 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  23.75 
 
 		 537 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.32 
 
 		 496 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  26.24 
 
 		 526 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  30.94 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.48 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  22.66 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  28.8 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  29.83 
 
 		 503 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  25.27 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.14 
 
 		 510 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>