25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0560 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  100 
 
 		 539 aa  1061    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  36.19 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25.79 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  32.73 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  31.48 
 
 		 513 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  31.08 
 
 		 516 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  31.16 
 
 		 544 aa  86.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  26.8 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  27.56 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  30.09 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  23.5 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  33.16 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  23.5 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.89 
 
 		 610 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  25.89 
 
 		 597 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  21.05 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.36 
 
 		 596 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  27.96 
 
 		 494 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  22.77 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.6 
 
 		 864 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 505 aa  43.9  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 496 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>