50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0372 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  85.91 
 
 		 513 aa  837    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  71.34 
 
 		 512 aa  700    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1008    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  66.67 
 
 		 516 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  30.88 
 
 		 583 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  30.21 
 
 		 541 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  31.69 
 
 		 544 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  29.45 
 
 		 534 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  27.72 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  30.42 
 
 		 507 aa  104  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  25.87 
 
 		 497 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  25.87 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  25 
 
 		 610 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  32.51 
 
 		 539 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  29 
 
 		 597 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.57 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.61 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.12 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.28 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.77 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  27.92 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.87 
 
 		 465 aa  67  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  26.09 
 
 		 582 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  25.89 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  30.05 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  28.88 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  24.75 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  27.71 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  27.93 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  25.85 
 
 		 510 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 505 aa  51.6  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  26.04 
 
 		 497 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  21.14 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 526 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  22.96 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.13 
 
 		 864 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  23.02 
 
 		 475 aa  47.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  27.64 
 
 		 508 aa  47  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  25.6 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  25.88 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  24.87 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 		 636 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  30.13 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  26.29 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  25.53 
 
 		 812 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  27.86 
 
 		 480 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>