21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3555 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  73.59 
 
 		 644 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 592 aa  1131    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  71.54 
 
 		 641 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  50.19 
 
 		 597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  28.47 
 
 		 497 aa  139  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  28.47 
 
 		 497 aa  138  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  33.8 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.36 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  29.13 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  27.02 
 
 		 502 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  28.88 
 
 		 502 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  29.42 
 
 		 503 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.2 
 
 		 610 aa  77.8  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  31.65 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  26.71 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  34.02 
 
 		 502 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30.61 
 
 		 2272 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.61 
 
 		 2179 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  23.28 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  28.9 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  27.91 
 
 		 534 aa  48.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>