18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1209 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  87.08 
 
 		 502 aa  770    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1014    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  71.8 
 
 		 502 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  65.47 
 
 		 502 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  69.18 
 
 		 503 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  61.08 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  60.69 
 
 		 522 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  29.08 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.56 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  26.58 
 
 		 597 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  27.38 
 
 		 644 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  28.63 
 
 		 641 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  23.47 
 
 		 610 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  20.79 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.09 
 
 		 507 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  20.55 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  26.83 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  22.01 
 
 		 497 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>