16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1082 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  951    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  87.08 
 
 		 528 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  72.4 
 
 		 502 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  66.27 
 
 		 502 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  69.98 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  61.68 
 
 		 502 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  61.19 
 
 		 522 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  28.94 
 
 		 592 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  26 
 
 		 597 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.29 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  29.19 
 
 		 644 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  27.34 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  29.04 
 
 		 641 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  22.81 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  22.58 
 
 		 497 aa  87.4  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  22.51 
 
 		 610 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>