20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3220 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  81.71 
 
 		 522 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  957    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  65.47 
 
 		 528 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  66.27 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  64.94 
 
 		 502 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  62.95 
 
 		 502 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  68 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  27.95 
 
 		 592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  29.12 
 
 		 597 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  28.32 
 
 		 641 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.86 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  29.46 
 
 		 644 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  22.91 
 
 		 497 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  22.91 
 
 		 497 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.37 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  25.25 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  27.23 
 
 		 497 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 636 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  24.83 
 
 		 510 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>