22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3054 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  73.59 
 
 		 592 aa  716    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  73.27 
 
 		 641 aa  801    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  100 
 
 		 644 aa  1247    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  54.42 
 
 		 597 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  26.74 
 
 		 497 aa  130  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  26.74 
 
 		 497 aa  130  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  33.98 
 
 		 507 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.66 
 
 		 537 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  29.68 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  27.79 
 
 		 528 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  29.81 
 
 		 502 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  28.01 
 
 		 502 aa  87.8  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  27.1 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  27.31 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.51 
 
 		 610 aa  78.2  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  24.83 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  26.86 
 
 		 535 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  30.95 
 
 		 502 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  25.05 
 
 		 534 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  24.4 
 
 		 583 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  23.96 
 
 		 513 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>