34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2617 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  100 
 
 		 535 aa  1035    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  39.47 
 
 		 534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  38.25 
 
 		 541 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  29.22 
 
 		 512 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  29.53 
 
 		 583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  27.72 
 
 		 513 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  27.02 
 
 		 513 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  27.29 
 
 		 516 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  30.05 
 
 		 537 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  27.19 
 
 		 544 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  24.65 
 
 		 497 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  24.7 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.41 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  21.63 
 
 		 610 aa  80.5  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  25.64 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  24.77 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  27.42 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  31.78 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  22.51 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  27.99 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  27.04 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  25 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  24.79 
 
 		 498 aa  50.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  23.4 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  25 
 
 		 528 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  29.14 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  29.8 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 493 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  24.88 
 
 		 481 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>