21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1227 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1227  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  967    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1082  hypothetical protein  72.4 
 
 		 502 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833107  normal  0.549448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1209  hypothetical protein  71.8 
 
 		 528 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.688773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3220  hypothetical protein  62.95 
 
 		 502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4360  hypothetical protein  65.4 
 
 		 503 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370821  normal  0.0122553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2344  hypothetical protein  59.36 
 
 		 502 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805684  normal  0.161945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2597  hypothetical protein  57.71 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.606955  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  26.89 
 
 		 592 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.58 
 
 		 537 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  25.44 
 
 		 597 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  27.22 
 
 		 641 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  23.36 
 
 		 497 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  23.36 
 
 		 497 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  25.54 
 
 		 644 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  22.51 
 
 		 610 aa  81.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  27.23 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  24.33 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 636 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  29.58 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  23.71 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  25.21 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>