21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1664 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  70.91 
 
 		 497 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  86.92 
 
 		 497 aa  823    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  995    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  21.26 
 
 		 497 aa  95.9  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  21.21 
 
 		 497 aa  93.6  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  21.69 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  30.17 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  29.74 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 636 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  28.65 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  22.55 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.09 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  28.37 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  28.41 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  27.35 
 
 		 513 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.88 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  25.7 
 
 		 534 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.19 
 
 		 537 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  29.21 
 
 		 507 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>