26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3820 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  72.38 
 
 		 497 aa  732    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  86.92 
 
 		 503 aa  849    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  983    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  21.36 
 
 		 497 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  21.24 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  21.9 
 
 		 610 aa  73.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  28.93 
 
 		 583 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  29.81 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  28.99 
 
 		 512 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.96 
 
 		 864 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  22.36 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 636 aa  57  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  28.24 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  26.73 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  28.14 
 
 		 505 aa  54.3  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  31.07 
 
 		 507 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 505 aa  53.9  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  22.63 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  26.18 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  27.1 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  25.56 
 
 		 812 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  26.43 
 
 		 526 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  23.79 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.98 
 
 		 582 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>