47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7230 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1173    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  50.39 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  32.35 
 
 		 512 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  31.81 
 
 		 513 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  33.4 
 
 		 516 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  32.61 
 
 		 513 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  29.67 
 
 		 541 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  30.56 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  29.74 
 
 		 535 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  30.25 
 
 		 497 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  30.25 
 
 		 497 aa  100  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.24 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  27.56 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  28.17 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.75 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  29.61 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  22.68 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  27.55 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  26.34 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  25.71 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 526 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.04 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  24.08 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  24.14 
 
 		 502 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  22.97 
 
 		 864 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.23 
 
 		 505 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.89 
 
 		 557 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  23.96 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  21.78 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  27.76 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  24.29 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  22.65 
 
 		 582 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  23.71 
 
 		 508 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  25.93 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.23 
 
 		 502 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  24.64 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  25.79 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.23 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  24.27 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.43 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  20.83 
 
 		 461 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  26.09 
 
 		 641 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  20.64 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  24.18 
 
 		 505 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  22.22 
 
 		 510 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 518 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>