45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0469 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  100 
 
 		 510 aa  1031    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  46.94 
 
 		 503 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  43.66 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  48.16 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 518 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  28.45 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  24.9 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  25.99 
 
 		 506 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  28.54 
 
 		 527 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  26.76 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  26.05 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  24.32 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  26.1 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  27.78 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  26.34 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.31 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  27.31 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  27.93 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 812 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  24.26 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  25.65 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  28.11 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  26.74 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.5 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  29.95 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  27.41 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 496 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  25.75 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  27.41 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  23.88 
 
 		 583 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.99 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  28.33 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.57 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.02 
 
 		 502 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.28 
 
 		 496 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  26.57 
 
 		 490 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  27.98 
 
 		 513 aa  47  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.55 
 
 		 582 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  29.63 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  27.89 
 
 		 292 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  29.63 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  25.49 
 
 		 570 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>