50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2785 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  63.55 
 
 		 502 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  59.13 
 
 		 503 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  100 
 
 		 502 aa  1024    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  44.13 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  29.43 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  25.12 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  24.4 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  28.74 
 
 		 527 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  25.31 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  24.69 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.41 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  28.77 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  26.75 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  25.09 
 
 		 557 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  27.83 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  25.55 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  23.32 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  23.88 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  25.79 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.84 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.06 
 
 		 506 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  24.26 
 
 		 583 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  24.3 
 
 		 525 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  26.52 
 
 		 812 aa  53.9  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  26.29 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  28.41 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  22.27 
 
 		 506 aa  50.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  25.53 
 
 		 622 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  23.28 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  25.82 
 
 		 611 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 636 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  25.11 
 
 		 610 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  22.89 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 526 aa  47  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.83 
 
 		 531 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  22.46 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.57 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  21.27 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  21.35 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  22.7 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  24.3 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  24.87 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  26.91 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  23.85 
 
 		 544 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  27.03 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  25.3 
 
 		 473 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.03 
 
 		 505 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  26.24 
 
 		 480 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 476 aa  43.9  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>