49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5554 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1112    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  32.01 
 
 		 489 aa  183  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  33.15 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  39.66 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  33.79 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  32.39 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  33.66 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  35.76 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  37.71 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  37.81 
 
 		 527 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  38.19 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.88 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.05 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25.37 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  20.8 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  25.27 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  31.82 
 
 		 507 aa  57  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.91 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 496 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  47.69 
 
 		 509 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  30.28 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 498 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  26.47 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  29.21 
 
 		 498 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  24.89 
 
 		 557 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.26 
 
 		 465 aa  50.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  28.21 
 
 		 610 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.68 
 
 		 505 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  26.72 
 
 		 812 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0408  hypothetical protein  50.91 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  19.67 
 
 		 487 aa  48.5  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  29.02 
 
 		 512 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.12 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  27.24 
 
 		 513 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 476 aa  47.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  24.11 
 
 		 509 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  28.47 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  26.95 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  23.65 
 
 		 550 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  23.65 
 
 		 550 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  37.36 
 
 		 537 aa  43.9  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  31.1 
 
 		 503 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.807875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>