58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6991 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  992    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  54.73 
 
 
489 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  46.12 
 
 
500 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3570  hypothetical protein  41.1 
 
 
525 aa  240  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308426  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11030  hypothetical protein  34.41 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
518 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  30.18 
 
 
526 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  35.67 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  31.88 
 
 
504 aa  177  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2492  hypothetical protein  32.54 
 
 
490 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0407  hypothetical protein  36.36 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0379  hypothetical protein  36.55 
 
 
509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4134  hypothetical protein  36.17 
 
 
292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0408  hypothetical protein  36.36 
 
 
509 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  36.65 
 
 
570 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  25.93 
 
 
510 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
502 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  24.88 
 
 
502 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  23.82 
 
 
503 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.68 
 
 
582 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
496 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
497 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  31.13 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
498 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  28.75 
 
 
494 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  29.13 
 
 
505 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  29.66 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  25.23 
 
 
465 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.33 
 
 
496 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.54 
 
 
488 aa  57.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  21.96 
 
 
475 aa  57.4  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
526 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
636 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  29.91 
 
 
527 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.28 
 
 
505 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  21.69 
 
 
461 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  28.13 
 
 
498 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  29.61 
 
 
503 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  19.71 
 
 
487 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  31.11 
 
 
498 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  24.66 
 
 
497 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  24.66 
 
 
497 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  30.15 
 
 
520 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.85 
 
 
531 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  29.95 
 
 
583 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.91 
 
 
502 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  25 
 
 
512 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.09 
 
 
864 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  26 
 
 
514 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  22.51 
 
 
461 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  22.05 
 
 
557 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  23.67 
 
 
550 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  23.67 
 
 
550 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  31.55 
 
 
507 aa  43.5  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>