80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0294 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  948    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  93.02 
 
 
473 aa  854    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  49.15 
 
 
480 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  35.75 
 
 
527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
526 aa  193  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  32.15 
 
 
498 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.47 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  24.49 
 
 
487 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  26.71 
 
 
812 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  25.56 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  24.13 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.87 
 
 
528 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.66 
 
 
531 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  29.21 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  25.19 
 
 
622 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  23.51 
 
 
557 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.64 
 
 
596 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  23.83 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  20.99 
 
 
512 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.61 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  27.27 
 
 
508 aa  73.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  29.85 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  29.32 
 
 
582 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  29.13 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  27.52 
 
 
611 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
497 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  25.15 
 
 
550 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  25.15 
 
 
550 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  29.52 
 
 
494 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  28.16 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  28.13 
 
 
505 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25 
 
 
518 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.16 
 
 
528 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  31.82 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  27.13 
 
 
475 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
496 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  29.19 
 
 
505 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  24.74 
 
 
615 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  24.74 
 
 
615 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  29.19 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.73 
 
 
496 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 
503 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  27.02 
 
 
502 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3624  glycosyltransferase  32.6 
 
 
587 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
505 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  27.06 
 
 
499 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  26.36 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  44.44 
 
 
505 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3074  glycosyltransferase  26.32 
 
 
513 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0020891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  25.41 
 
 
534 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  27.03 
 
 
512 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 
636 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
498 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.47 
 
 
502 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
502 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  26.64 
 
 
541 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  25.79 
 
 
526 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
518 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
534 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
520 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  24.91 
 
 
497 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  27.1 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  28.04 
 
 
499 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  28.05 
 
 
493 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  24.14 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  25.61 
 
 
503 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  25 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  28.92 
 
 
734 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  25 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  22.84 
 
 
583 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  43.9 
 
 
864 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  23.31 
 
 
520 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.73 
 
 
505 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>