25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3074 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3074  glycosyltransferase  100 
 
 		 513 aa  976    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0020891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  25.65 
 
 		 498 aa  97.8  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.1 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  27.81 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 526 aa  70.1  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  24.42 
 
 		 812 aa  67  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  26.97 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  27.51 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  23.73 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 497 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  29.48 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 636 aa  53.9  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 496 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.61 
 
 		 864 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  23.73 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  29.14 
 
 		 514 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  31.33 
 
 		 528 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.58 
 
 		 528 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  21.47 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  25.43 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.56 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  32.51 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  26.19 
 
 		 519 aa  43.5  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>