78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1801 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
497 aa  981    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  70.79 
 
 
494 aa  683    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  67.94 
 
 
496 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  91.28 
 
 
496 aa  859    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  62.1 
 
 
498 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  62.04 
 
 
505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  60.99 
 
 
498 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  55.08 
 
 
513 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.98 
 
 
488 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  34.44 
 
 
582 aa  192  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
553 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  31.06 
 
 
509 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  29.69 
 
 
465 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  43.62 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
636 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.71 
 
 
864 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  43.44 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.57 
 
 
496 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.6 
 
 
505 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  24.82 
 
 
487 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.05 
 
 
528 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.01 
 
 
518 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.98 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  29.45 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  26.49 
 
 
498 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  32.27 
 
 
461 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  30.96 
 
 
527 aa  97.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  29.74 
 
 
475 aa  94.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
526 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.84 
 
 
531 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  26.1 
 
 
512 aa  90.9  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
502 aa  90.1  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  27.27 
 
 
557 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  21.56 
 
 
490 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  22.71 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  27.37 
 
 
812 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  30.94 
 
 
513 aa  84  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  28.41 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  33.33 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  27.12 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.14 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  32.52 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  32.52 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  32.35 
 
 
611 aa  74.7  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  31.19 
 
 
622 aa  73.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.76 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  28.97 
 
 
520 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  25.97 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
518 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  25.79 
 
 
526 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
520 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  21.66 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  28.84 
 
 
493 aa  61.6  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  30.13 
 
 
615 aa  61.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  30.13 
 
 
615 aa  61.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
516 aa  60.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  24.21 
 
 
473 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  25 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  30.05 
 
 
510 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  28.23 
 
 
512 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  24.75 
 
 
497 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  24.75 
 
 
497 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  30.92 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3074  glycosyltransferase  31.11 
 
 
513 aa  53.5  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0020891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  28.57 
 
 
506 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  28.21 
 
 
534 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  25.39 
 
 
513 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  30.14 
 
 
503 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  28.87 
 
 
527 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  21.36 
 
 
502 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
483 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2186  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  30.2 
 
 
539 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  25.51 
 
 
504 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  29.63 
 
 
597 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  27.91 
 
 
505 aa  43.9  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  27.89 
 
 
507 aa  43.5  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>