52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3624 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3624  glycosyltransferase  100 
 
 		 587 aa  1102    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  31.51 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  26.75 
 
 		 812 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  31.24 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.28 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  25.71 
 
 		 506 aa  83.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.96 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  26.08 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  35.38 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  32.81 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  23.39 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.84 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.92 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  23.73 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  31.73 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  28.1 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  27.99 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  27.6 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.8 
 
 		 864 aa  58.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  29.8 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  27.6 
 
 		 461 aa  57  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.76 
 
 		 582 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.67 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 496 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  29.34 
 
 		 490 aa  53.9  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  24.78 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  24.78 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.04 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.07 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  44.3 
 
 		 556 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 		 498 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  40.26 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.12 
 
 		 502 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  27.32 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  25 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  23.56 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  28.96 
 
 		 505 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  27.03 
 
 		 499 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.99 
 
 		 537 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.27 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  30.39 
 
 		 499 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  24.26 
 
 		 502 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 		 520 aa  43.5  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 505 aa  43.5  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>