64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0356 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  71.34 
 
 		 513 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  71.88 
 
 		 513 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  64.71 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  32.35 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  30.85 
 
 		 541 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  29.22 
 
 		 535 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  30.7 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0558  hypothetical protein  30.69 
 
 		 544 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345712  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  26 
 
 		 610 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  25.07 
 
 		 497 aa  90.5  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0560  glycosyltransferase  32.73 
 
 		 539 aa  90.1  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  33.33 
 
 		 507 aa  90.1  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  25.07 
 
 		 497 aa  90.1  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  30.77 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  25.51 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.93 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.73 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  25.25 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  25.19 
 
 		 582 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.44 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  31.15 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  31.15 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.44 
 
 		 505 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  24.63 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  25 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  24.02 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  27.83 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  25.55 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  28.99 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  26.56 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  26.63 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  26.4 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 496 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  23.15 
 
 		 812 aa  57  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  29.02 
 
 		 527 aa  57  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 636 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  27.29 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 497 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  29.68 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  26.22 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  28.45 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.36 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  22.71 
 
 		 475 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  28.61 
 
 		 499 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.64 
 
 		 864 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  26.63 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  27.63 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  25.54 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  24.33 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  22.5 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  25.9 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  26.11 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  28.84 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  24.55 
 
 		 526 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  27.18 
 
 		 505 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29 
 
 		 536 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 493 aa  43.5  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>