69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3206 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  100 
 
 
488 aa  931    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  47.59 
 
 
476 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  36.22 
 
 
505 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
496 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  37.47 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
496 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
498 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  42.91 
 
 
497 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 
553 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  36.25 
 
 
498 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  30.94 
 
 
582 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
513 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  32.29 
 
 
509 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  29.7 
 
 
465 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  24.89 
 
 
487 aa  143  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.39 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  26.83 
 
 
506 aa  126  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.44 
 
 
505 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  29.04 
 
 
498 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  33.55 
 
 
527 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.41 
 
 
518 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
502 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
636 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  38.03 
 
 
864 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
505 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.44 
 
 
528 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.45 
 
 
528 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  22.59 
 
 
512 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  30.29 
 
 
557 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  28.94 
 
 
520 aa  93.2  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  25.11 
 
 
513 aa  90.9  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
505 aa  90.1  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.1 
 
 
531 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  32.46 
 
 
550 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  32.46 
 
 
550 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  32.64 
 
 
461 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  29.24 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  34.55 
 
 
812 aa  83.6  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.44 
 
 
596 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  27.54 
 
 
489 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  32.12 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  28.46 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  26.89 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  33.46 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  34.6 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  28.12 
 
 
622 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
516 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  28.89 
 
 
490 aa  67  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  28.04 
 
 
493 aa  65.1  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
502 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  28.54 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  27.12 
 
 
611 aa  60.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  31.35 
 
 
526 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
518 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  26.91 
 
 
480 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
520 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  27.76 
 
 
615 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  27.76 
 
 
615 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  30.53 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3980  hypothetical protein  27.92 
 
 
504 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  30.77 
 
 
497 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  30.77 
 
 
497 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  29.41 
 
 
513 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  26.34 
 
 
516 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  29.96 
 
 
513 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  35.35 
 
 
527 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  31.12 
 
 
570 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  30.08 
 
 
503 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>