72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2597 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
498 aa  986    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  83.33 
 
 
498 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  63.19 
 
 
494 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  62.88 
 
 
496 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  61.84 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  62.05 
 
 
505 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  62.1 
 
 
497 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  54.14 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  36.03 
 
 
488 aa  193  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  35.53 
 
 
582 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  31.13 
 
 
465 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  45.2 
 
 
476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  32.09 
 
 
509 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
636 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.41 
 
 
864 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.44 
 
 
518 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  27.43 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.44 
 
 
496 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  42.6 
 
 
505 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  34.82 
 
 
498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.28 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  33.02 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.35 
 
 
505 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.94 
 
 
531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  40.68 
 
 
502 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  22.17 
 
 
512 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  32.54 
 
 
461 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  30.36 
 
 
527 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  31.2 
 
 
475 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  23.17 
 
 
506 aa  99  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  24.3 
 
 
812 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  26.79 
 
 
557 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
502 aa  87.4  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  23.09 
 
 
550 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  23.09 
 
 
550 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  23.29 
 
 
490 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  28.27 
 
 
513 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  26.93 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  28.04 
 
 
480 aa  84  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  33.79 
 
 
611 aa  84  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.66 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
526 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  27.81 
 
 
506 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.78 
 
 
596 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  26.7 
 
 
622 aa  77  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  27.95 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  27.94 
 
 
493 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  29.58 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  31.96 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  28.83 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6991  hypothetical protein  32.94 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  27.53 
 
 
615 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  27.53 
 
 
615 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
520 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  31.79 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  31.21 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
516 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2629  hypothetical protein  28.16 
 
 
500 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  25 
 
 
497 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  25 
 
 
497 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
518 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  23.72 
 
 
512 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  25.77 
 
 
534 aa  50.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  24.19 
 
 
597 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  25.4 
 
 
513 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4193  hypothetical protein  30.73 
 
 
527 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3074  glycosyltransferase  27.63 
 
 
513 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0020891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  27.57 
 
 
507 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5554  hypothetical protein  30.46 
 
 
570 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352813  normal  0.911624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>