31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1410 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1018    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  43.17 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  42.38 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  41.14 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  40.53 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  39.76 
 
 		 497 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  41.82 
 
 		 496 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 483 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  32.62 
 
 		 505 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  33.09 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  28.21 
 
 		 506 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  30.3 
 
 		 481 aa  93.6  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  29.18 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  27.27 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  26.87 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  28.51 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  24.89 
 
 		 527 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  25.51 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  24.62 
 
 		 487 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  31.07 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  23.42 
 
 		 513 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  23.47 
 
 		 583 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  27.64 
 
 		 513 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3659  hypothetical protein  25.68 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  29.27 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.48 
 
 		 864 aa  43.5  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 505 aa  43.9  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>